martes, 8 de septiembre de 2020

jueves, 27 de agosto de 2020

Juegue y ayude a la ciencia

 Los avances en Inteligencia Artificial son cada día más frecuentes y ahora es más fácil buscar un área en la que no se esté o se pueda aplicar.  

La primera aplicación que viene a mi mente es la de automatización de procesos de seguridad, donde existen baterías de pruebas que ejecutan, pero los mejores sistemas pueden detectar esta serie de pruebas ejecutadas en ráfaga, y levantan alarmas de protección. La IA automatiza el proceso agregando posiblemente algo más de adaptabilidad para no levantar alarmas ni sospechas.

Otras áreas incluyen el análisis de imágenes para detectar o segmentar semánticamente objetos. En este caso, las computadoras ya superan a los humanos en velocidad y precisión; y por esta razón otro tema "candente" son las implementaciones de vehículos autónomos. 

Es decir, existen áreas / tareas en las que las computadoras superar el rendimiento humano promedio, y hasta el alto rendimiento (alguien dijo Kasparov vs. Deep Blue?). También se escuchan aplicaciones en genética en época de pandemia.  

Sin embargo, en algunas tareas todavía se puede usar a los humanos para resolver tareas complejas.   Por ejemplo en casos de aprendizaje supervisado Google generó un juego para etiquetar partes de una foto, para luego procesar automáticamente todas las fotos que subimos en nuestras redes. De la misma forma Facebook ha desarrollado el mismo algoritmo y cuando se tiene una conexión a internet lenta es posible ver el etiquetado "la imagen puede contener ... ", mientras se carga la realmente la foto. 

La idea de "gamificación" o ludificación de estas actividades no es cosa nueva. De todas formas recientemente me enteré sobre este juego que ha ayudado a desdoblar encimas de formas más rápidas que con algoritmos tradicionales, de allí su nombre de "doblar"; la dirección para los curiosos es:

https://fold.it/

Una idea interesante cuando todavía sirven los humanos para realizar estas tareas. Entonces mejor colaborar - jugar ahora.


martes, 4 de agosto de 2020

URL de libros abiertos

Recuerdo tiempos antiguos cuando lo difícil era tener acceso a un libro. Especialmente en el contexto de la educación superior. La nueva edición de un libro tenía costos variables de 50 a 200 USD. Y lo malo era que estaba en inglés, esperar la traducción del libro al español / castellano implica un periodo de 2 años más a la espera. Entonces mejor aprender a leer en inglés, no?

Luego durante mis estudios entendí que la información más avanzada no estaba en los libros sino en los últimos artículos científicos publicados. Una vez más, el problema era el acceso ya que las empresas que cobran a los investigadores para publicar sus trabajos, también cobran a los lectores para acceder al documento.
Con valor nominal de 30 USD por artículo, tranquilamente se puede requerir de entre 30 a 50 artículos para entender un poco mejor algún tema.  El costo es la primera barrera de acceso.

Poco a poco la idea de la sociedad abierta (Open Society) va calando en la población. Esta idea de acceder a ciencia abierta es sin duda el nuevo reto de este siglo.  Se ha tomado lo mejor del software abierto (open software o código abierto y sin licencias propietarias), y ahora con la gran cantidad de datos existente, la tendencia es hacia open data o datos abiertos. Existen repositorios donde los datos usados para publicaciones están disponibles cuando el artículo está publicado con open access o acceso abierto. La idea nueva es que los datos son citables o referenciables sin necesidad de agregar un autor a la publicación.
En un futuro no muy lejano se espera poder acceder a laboratorios abiertos con miras a la ciencia abierta. Muestra de esto son las viejas "test beds" o cama de preubas usadas para investigación de redes de sensores inalámbricos. Donde mucho dinero se invertió para tener los equipos listos para configurarse de manera semi-autómatica y así probar el rendimiento de nuevos protocolos.
De la misma manera, ahora existen super computadoras o agrupaciones (clusters) que sería interesante comprobar el tiempo de uso real de toda esa capacidad de cálculo. Por lo pronto no conozco de ninguna posibilidad de usar estos equipos de manera gratuita.

Volviendo al ejemplo de los libros, muchas veces es discutible sobre la calidad de la revisión de pares pues la idea central es que si nuestro señor y salvador (el mercado) lo acepta como un producto viable no nos interesa realmente su calidad.

Pero, y si alguien más ya pagó por el libro? sería esta una oportunidad para "liberar" los derechos del libro y colocar en algún sitio web para su descarga?

En todo caso les dejo un par de enlaces a dos libros de acceso abierto en el marco de un proyecto de educación.

ICT and education in the perspective of experts from business, government, academia and NGOs in Europe, Latin America and Caribbean


ICT FOR LEARNING AND INCLUSION IN LATIN AMERICA AND EUROPE  CASE STUDY FROM COUNTRIES: BOLIVIA, BRAZIL, CUBA, DOMINICAN REPUBLIC, ECUADOR, FINLAND, POLAND, TURKEY, URUGUAY



sábado, 11 de julio de 2020

Global Forest Watch

GIS sobre el uso y estado de los bosques a nivel mundial. 

me queda la duda sobre el método para realizar el cálculo.

jueves, 2 de julio de 2020

hey kids, do you want some ...... lectures?


La educación superior o las universidades muchas veces son instituciones en las que no se ha visto mayor cambio en los últimos 200 años.  Muchas veces el uso de tecnología es algo que no se considera.
En mi época lo más difícil era obtener acceso a libros y material, sin embargo actualmente con el aumento masivo en el acceso a Internet la cantidad de material aumenta, pero también varia la calidad.

Iniciativas pioneras como la del MIT OCW da pautas para el uso y acceso a grabaciones de clases y en algunas ocasiones a otros materiales como artículos y ejercicios, etc. (véase la entrada de blog http://barrosjuan.blogspot.com/2017/08/ideas-recicladas.html )

Hoy en día está muy de moda temas de reconocimiento de patrones con diferentes aplicaciones y usando variadas técnicas. 
Es así que me llegó este enlace a la universidad Frederico - Alejandro Universidad FAE.de  desde Alemania:


La parte importante está en "lecture notes".
A aprovechar la tecnología para aprender mejor.

martes, 16 de junio de 2020

problemas de tránsito a reportar

Plataformas de reporte de problemas del tránsito. Un simpático proyecto. 
https://repubikla.herokuapp.com/ pero no hay datos en Ecuador.

Pero si se desea subir información sobre Modal Split? se puede hacer a mano en:

como se indicó en esta entrada. 
Si desean pueden colaborar con sus datos.

jueves, 11 de junio de 2020

Ciencia que sirva a la "nación"

La presión hacia la generación de ciencia con impacto en la sociedad es cada vez mayor.  Recuerdo un singular método de protesta realizado por los investigadores en Francia cuando el presidente anunció la reducción al presupuesto para la investigación científica.  En aquella ocasión, enviaron por correo a la presidencia varios artículos de su autoría, para que el ejecutivo con su "gran experiencia" en ciencias pueda distinguir entre buena ciencia y entre publicaciones que tienen impacto social o que son beneficiosas para la nación.

La verdad que podemos encontrar buenos argumento de cada lado. Muchas veces siento que en Ecuador se hace y se puede hacer "buena" ciencia. Personas publican sus trabajos en conferencias y revistas especializadas. Sin embargo, siempre queda el sin-sabor de estar a la altura de otros países pero no a la altura de los requerimientos del país propio. Como si, a más de investigar deberíamos trabajar para que los resultados se incluyan en los sistemas productivos y de bienestar.

Gobiernos de diferentes orientaciones se han visto tentados a usar el mismo argumento, algunos por falta de dinero y otros con ganas de desviar fondos a otros lugares (públicos o privados). 

Hace poco leí la historia "simplificada" del análisis PCR, tan útil para toda la humanidad en estos momentos de COVID19. La historia está publicada en:
La moraleja, si existiera alguna, es que financiar proyectos que generen conocimiento en áreas diversas (no solo en las de impacto social o a la nación) ayuda a que otros métodos se puedan (o no) desarrollar con aplicaciones en otros ámbitos muy diferentes a las iniciales.

EXTRACTO
PCR (siglas en inglés de ‘Reacción en Cadena de la Polimerasa’) para localizar y amplificar fragmentos de material genético.
1966 sep. Thomas D. Brock (Universidad de Indiana) en el Parque Nacional de Yellowstone.  Hudson Freeze recogieron muestras de Mushroom Spring.
El microorganismo anaranjado no creció, pero en algunas placas apareció una nueva bacteria que podía crecer hasta los 78 grados y que no podía hacerlo por debajo de los 45 (Thermus aquaticus).

1989 David H. Gelfand, empresa, Cetus (patente Taq polimerasa), por Kary Mullis (Premio Nobel 1993): la PCR. PCR es una especie de fotocopiadora molecular que permi­te realizar tantas copias como se quiera de un fragmento de ADN seleccionado.
La forma de seleccionar este fragmento y no otro consis­te en mezclar el ADN de la muestra que se va a analizar con dos pequeños fragmentos de ADN que se denominan ceba­dores. Al calentar la muestra con estos cebadores, la doble cadena se separa. Al enfriarla a continuación, los cebadores se hibridan con el fragmento de ADN complementario de su se­cuencia. Si los hemos elegido correctamente, nuestros ceba­dores se unirán al principio y al final del gen que buscamos. En este momento, añadimos la enzima que duplica el ADN, la ADN polimerasa, para que se una al cebador y comience a replicar el ADN. La enzima no puede replicar una cadena de ADN a menos que parta desde un cebador, de ahí el nom­bre.
en cada ciclo, al calentar la muestra, la polimerasa se desnaturalizaba y había que volver a añadir más enzima.

miércoles, 10 de junio de 2020

Emprendimientos - mapas

En Ecuador es muy raro encontrar empresas o emprendimientos que nazcan o que estén apoyados por las universidades.
Hace poco tuve la oportunidad de asistir a la presentación de la empresa Inno-Maps. Aquí les dejo el enlace:


A la fecha ofrecen:
7 - Mapas Urbanos
3 - Productos
4 - Métodos de Análisis

Esperemos lo mejor y a seguir emprendiendo.

domingo, 17 de mayo de 2020

el pacto moderno - the modern covenant

Renunciar al sentido para ganar poder.

Vampiros vs banqueros:
El crédito es confianza en el futuro.
Compañías tekmira y BioCryst mejora el precio de acciones durante pandemias.
Vampiros prestan y cobran sangre, pero el banquero cobra con intereses.  (R.1 1984)

El pastel mágico:
La religión del crecimiento económico y su solución a dilemas éticos.
Lo descuidado: igualdad social, armonía ecológica, honrar padres.
El capitalismo como religión promete y ha cumplido algunos deseos.

El síndrome del arca:
3 criterios: materia prima, energía (decrecen), conocimiento (crece).
Contentarse con crecimiento menor, o seguir persiguiendo el crecimiento?
Domo privado solo para ricos x calidad del aire en china. (R. 3 ) 

Carrera de ratas:
Estándares de vida han mejorado como nunca, pero siempre se quiere más.
El equilibrio (no crecer) es más temido que nada.
El capitalismo se mantiene gracias a la nueva religión: el humanismo.

Algunas frases resumen del capítulo 6 "el pacto moderno" del libro "Homo Deus" de Yuval Noah Harari.

jueves, 14 de mayo de 2020

la vida en tiempos del COVID19

Hablando de la importancia de los datos abiertos para mejorar la colaboración a nivel mundial, existen varias fuentes de información.
Ver por ejemplo:

https://artic.network/ncov-2019

que presenta manuales para usar las herramientas para utilizar los datos obtenidos luego de la secuenciación de ADN.

https://artic.network/ncov-2019/ncov2019-bioinformatics-sop.html 

La información gráfica siempre es interesante. ver por ejemplo los gráficos presentados en:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947.3?report=graph


De la misma manera, existen alternativas para la visualización de los datos. Ver pro ejemplo
https://nextstrain.org/ncov/global


En fin, algo más de información para aprender usando la tecnología actual.

domingo, 23 de febrero de 2020

Rutas ceca de Cuenca, trail y caminata


¿Cómo puedo compartir información sobre rutas de diferentes actividades al aire libre que he realizado?
Bueno en realidad existen varias alternativas, quizás la más sencilla es usar un servicio como https://OpenStreetMap.org  para crear las rutas en caso de que no existan. Además se pueden compartir archivos gpx desde un dispositivo gpx y compartirlo con el mundo.

Una segunda alternativa es usar un servicio como wikiloc https://www.wikiloc.com/, el cual permite estructurar las rutas según el archivo de trazas o gpx.

Hace poco en Cuenca se desarrolló un sitio web con rutas para trail y para caminatas con rutas que quizás no son conocidas por la gran mayoría del público, el enlace es:
http://caminantescuenca.org/
Las rutas están disponibles en formato gpx, pdf, y otros formatos compatibles con algunos dispositivos.

En mi caso, un archivo Fit o un archivo gpx pueden ser enviados a un reloj con GPS y de esta forma un celular o reloj nos pueden ayudar a seguir el camino.

8nteresante información para los que  gustande actividades al aire libre o si se encuentran de turistas en la ciudad. Buen paseo.


miércoles, 19 de febrero de 2020

Centollo Centolla

Hace poco conocí un nuevo animal que se consume en la región caribeña. Me lo presentaron con el nombre de centollo o centolla.  Una especie de crustáceo con patas mucho más grandes que las del cangrejo que se encuentra en Ecuador.
Interesante nombre para este animalito.